10.《Python数据分析》数据聚合与分组计算
发表评论
569 views

1 分组机制

按照指定的行列取值进行分组，并按组进行计算（求和、均值、标准差等）

代码示例：

df = pd.DataFrame({'key1' : ['a', 'a', 'b', 'b', 'a'],
                    'key2' : ['one', 'two', 'one', 'two', 'one'],
                    'data1' : np.random.randn(5),
                    'data2' : np.random.randn(5)})
grouped = df['data1'].groupby(df['key1']) # 生成一个GroupBy对象
grouped.mean() # 计算每组的均值（自动过滤无法计算均值的非数值列）
means = df["data1"].groupby([df["key1"], df["key2"]]).mean() # 两层分组
for name, group in df.groupby('key1'): # GroupBy对象支持迭代
     print(name)
     print(group)
pieces = {name: group for name, group in df.groupby("key1")} # 分组转dict

people = pd.DataFrame(np.random.randn(5, 5),
                       columns=['a', 'b', 'c', 'd', 'e'],
                       index=['Joe', 'Steve', 'Wes', 'Jim', 'Travis'])
people.iloc[2:3, [1, 2]] = np.nan # 混杂一些缺失值
mapping = {'a': 'red', 'b': 'red', 'c': 'blue',
            'd': 'blue', 'e': 'red', 'f' : 'orange'}
people.groupby(mapping, axis=1).sum() # 先映射再按照列进行聚合
people.groupby(len).sum() # 支持通过函数进行分组聚合

其他分组聚类常用技巧：

  • 分组所依赖的键在分组后会转化为索引，所以多分组的聚合运算结果会是多层次索引的
  • 可以通过参数as_index=False显式地取消用于分组的键被用作索引
  • 针对多层次索引，可以通过参数level指定根据具体哪一层进行分组
  • 不同分组方式（列，索引，函数，映射序列）之间可以混合使用
  • 多分组的结果会是多层次索引的形式，可以使用unstack或reset_index处理索引

2 数据聚合

常用聚合方法：size/count计数，sum求和，min/max最小值/最大值，first/last第一个/最后一个，mean均值，median中位数，prod积，any/all逻辑运算，cummin/cummax/cumsum/cumprob累积最小/最大/和/积，quantile分位数，rank次序，std/var标准差/方差，nth第N个数，ohlc开始/最高/最低/结束

对于数值型的聚合运算，会先弃置缺失值再进行

还可以使用agg方法自定义聚合函数：

grouped = df.groupby("key1")
def peak_to_peak(arr):
     return arr.max() - arr.min()
grouped.agg(peak_to_peak)
grouped.agg(['mean', 'std', peak_to_peak]) # 一次性调用多个聚合函数
grouped.agg([('data1', 'mean'), ('data2', np.std)]) # 针对不同列定义不同的聚合函数
grouped.agg({'data1' : ['min', 'max'],'data2' : 'sum'}) # 使用字典进行更灵活的聚合

自定义聚合函数通常要比内置的聚合函数效率低很多

3 apply：更一般化的”拆分-处理-合并“

代码示例：

frame = pd.DataFrame({"data1": np.random.standard_normal(1000),
                      "data2": np.random.standard_normal(1000)})
quartiles = pd.cut(frame["data1"], 4) # cut函数将数值型转为类别数为4的类别型
def get_stats(group):
     return pd.DataFrame(
         {"min": group.min(), "max": group.max(),
         "count": group.count(), "mean": group.mean()}
     )

grouped = frame.groupby(quartiles)
grouped.apply(get_stats)
# 输出结果: 
#                             min       max  count      mean
# data1                                                     
# (-2.956, -1.23] data1 -2.949343 -1.230179     94 -1.658818
#                 data2 -3.399312  1.670835     94 -0.033333
# (-1.23, 0.489]  data1 -1.228918  0.488675    598 -0.329524
#                 data2 -2.989741  3.260383    598 -0.002622
# (0.489, 2.208]  data1  0.489965  2.200997    298  1.065727
#                 data2 -3.745356  2.954439    298  0.078249
# (2.208, 3.928]  data1  2.212303  3.927528     10  2.644253
#                 data2 -1.929776  1.765640     10  0.024750

grouped.agg(["min", "max", "count", "mean"]) # 另一种等价写法

如果不希望结果的行索引是数据间隔，可以在使用cut方法时添加参数labels=False

案例1：借助apply进行缺失填补

states = ["Ohio", "New York", "Vermont", "Florida",
           "Oregon", "Nevada", "California", "Idaho"]
group_key = ["East", "East", "East", "East",
              "West", "West", "West", "West"]
data = pd.Series(np.random.standard_normal(8), index=states)
data[["Vermont", "Nevada", "Idaho"]] = np.nan # 人为捏造缺失

def fill_mean(group):
     return group.fillna(group.mean())
data.groupby(group_key).apply(fill_mean) # 均值填补缺失

fill_values = {"East": 0.5, "West": -1}
def fill_func(group):
     return group.fillna(fill_values[group.name])
data.groupby(group_key).apply(fill_func) # 按组 依次用固定值填补缺失

案例2：分组计算加权平均值

df = pd.DataFrame({'category': ['a', 'a', 'a', 'a',
                                 'b', 'b', 'b', 'b'],
                    'data': np.random.randn(8),
                    'weights': np.random.rand(8)})
grouped = df.groupby('category')
get_wavg = lambda g: np.average(g['data'], weights=g['weights'])
grouped.apply(get_wavg)

原文中还有蒙特卡洛模拟，分组计算相关性，分组回归等案例，此处不再赘述

4 transform：“解包”分组聚合结果

df = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'c'] * 4,
                    'value': np.arange(12.)})

g = df.groupby('key')['value']
def get_mean(group):
     return group.mean()
g.transform(get_mean)
# 此方法会将分组计算的结果再传给原始数据（分组前的数据）
def normalize(x):
     return (x - x.mean()) / x.std()
g.transform(normalize) # 直接对数据进行分组标准化
g.apply(normalize) # 另一种等价写法
 (df['value'] - g.transform('mean')) / g.transform('std') # 等价写法

transform方法可以实现非常灵活、高效的向量化操作

5 透视表和交叉表

pandas中包含pivot_table函数，可以很方便地制作透视表

在计算多因子的分组计数时，使用crosstab制作交叉表会更方便

### 透视表示例
df = pd.DataFrame({"A": ["foo", "foo", "foo", "foo", "foo",
                         "bar", "bar", "bar", "bar"],
                   "B": ["one", "one", "one", "two", "two",
                         "one", "one", "two", "two"],
                   "C": ["small", "large", "large", "small",
                         "small", "large", "small", "small",
                         "large"],
                   "D": [1, 2, 2, 3, 3, 4, 5, 6, 7],
                   "E": [2, 4, 5, 5, 6, 6, 8, 9, 9]})
table = pd.pivot_table(df, values='D', index=['A', 'B'],
                       columns=['C'], aggfunc=np.sum)
table
# C        large  small
# A   B
# bar one    4.0    5.0
#     two    7.0    6.0
# foo one    4.0    1.0
#     two    NaN    6.0

### 交叉表示例
a = np.array(["foo", "foo", "foo", "foo", "bar", "bar",
              "bar", "bar", "foo", "foo", "foo"], dtype=object)
b = np.array(["one", "one", "one", "two", "one", "one",
              "one", "two", "two", "two", "one"], dtype=object)
c = np.array(["dull", "dull", "shiny", "dull", "dull", "shiny",
              "shiny", "dull", "shiny", "shiny", "shiny"],
             dtype=object)
pd.crosstab(a, [b, c], rownames=['a'], colnames=['b', 'c'])
# b   one        two
# c   dull shiny dull shiny
# a
# bar    1     2    1     0
# foo    2     2    1     2

更多细节可参阅官方API说明：pandas.pivot_table, pandas.crosstab

往年同期文章